Město Benešov nad Ploučnicí je spravováno zastupitelstvem, které rozhoduje o majetkoprávních úkonech obce a dalších záležitostech dle zákona č. 128/2000 Sb. o obcích a jeho novel. Rada je výkonným orgánem obce v oblasti samostatné působnosti a za její výkon odpovídá právě zastupitelstvu obce. Ve vedení města pak stojí starosta.